Kniha Češi pod hákovým křížem zachycuje události spojené s obsazením českých zemí nacisty a následných šesti let krvavého období existence Protektorátu Čechy a Morava.
Líčí například osudové hodiny prezidenta Emila Háchy v Berlíně, reakci armády na okupaci, anabáze vojáků prchajících do emigrace, nacistickou kulturní politiku a cenzuru novinářů, architektonickou přestavbu měst v duchu Třetí říše, hrůzy v Terezíně a pankrácké sekyrárně, mýty a fakta o české kolaboraci, život v sudetských oblastech či budování největšího cvičiště Waffen-SS nedaleko Prahy.
Přináší i příběhy hrdinů, jakými byl například letec Josef Bryks či herci Karel Höger a Anna Letenská. Přibližuje také život kontroverzní šedé eminence protektorátní kinematografie Wilhelma Söhnela nebo osudy Čechů, kteří kvůli složité národnostní situaci v některých oblastech původní republiky museli sloužit v jednotkách říšské branné moci. Nezapomíná ani na zločiny z posledních dní okupace a rovněž na pátrání po některých jejich aktérech.
Kniha se zakládá na rozhovorech s odborníky Karlem Strakou, Jindřichem Markem, Jakubem Končelíkem, Volkerem Mohnem, Milošem Hořejšem, Vojtěchem Blodigem, Jaromírem Mrňkou, Pavlem Kmochem a Martinem Krskem.
